Antibiotiques et microbiote
Les antibiotiques sont indispensables pour traiter de nombreuses infections bactériennes et ont révolutionné la médecine moderne. Leur utilisation demeure particulièrement importante en France : en 2024, plus de 860 prescriptions d’antibiotiques pour 1 000 habitants ont été enregistrées, plaçant la France au 2ᵉ rang des pays européens consommant le plus d’antibiotiques1.
Les antibiotiques n’agissent pas uniquement sur les bactéries responsables de l’infection : ils peuvent également affecter certaines bactéries bénéfiques de notre organisme, notamment celles du microbiote intestinal et vaginal. Ces modifications peuvent perturber l’équilibre et la diversité du microbiote. Alors, quels sont réellement les effets des antibiotiques sur le microbiote ? Et comment en prendre soin pendant et après un traitement antibiotique ?
Sommaire
Comment les antibiotiques agissent-ils sur le microbiote intestinal ?
Le microbiote intestinal est composé de milliards de micro-organismes qui participent notamment à la digestion, au fonctionnement normal du système immunitaire et à la protection contre les micro-organismes indésirables. Son équilibre et sa diversité jouent ainsi un rôle important dans le fonctionnement de notre organisme.
Les antibiotiques sont conçus pour combattre les bactéries responsables d’une infection. Cependant, leur action peut également toucher certaines bactéries qui composent naturellement notre microbiote intestinal. Selon le type d’antibiotique, la durée du traitement et les caractéristiques propres à chacun, la composition et la diversité du microbiote peuvent ainsi être modifiées.
Ces perturbations peuvent notamment favoriser l’apparition de troubles digestifs, comme la diarrhée associée aux antibiotiques.
Et les probiotiques ?
La question des probiotiques se pose souvent lors d’un traitement antibiotique. Certaines souches probiotiques ont notamment été étudiées pour leur intérêt dans la prévention de la diarrhée associée aux antibiotiques. Toutefois, les effets des probiotiques dépendent des souches utilisées : les résultats obtenus avec une souche ou une association de souches ne peuvent pas être généralisés à l’ensemble des probiotiques.
Les probiotiques d’intérêt médical permettent de fournir à l’intestin des bactéries vivantes pour contribuer à l’équilibre de la flore intestinale.
Quelles sont les conséquences des antibiotiques sur le microbiote ?
Les antibiotiques peuvent provoquer une dysbiose, c’est-à-dire un déséquilibre de composition microbienne du microbiote. Les conséquences sur le microbiote dépendent notamment du type d’antibiotiques et de la durée d’utilisation. Toutefois, des prises d’antibiotiques répétées et prolongées peuvent avoir des effets persistants sur la diversité et la composition du microbiote.
Diarrhée associée aux antibiotiques
La prise d’antibiotiques peut s’accompagner d’une diarrhée, notamment en raison des modifications qu’ils provoquent au niveau du microbiote intestinal. Elle peut survenir dès le début d’un traitement antibiotique, mais elle est reste possible jusqu’à deux mois après la fin de l’antibiothérapie. En général, les symptômes disparaissent progressivement et le microbiote se rétablit puisque notre monde bactérien est résilient mais ce processus peut prendre plusieurs mois.
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Infection à Clostridioides difficile
Dans certains cas, la prise d’antibiotiques peut favoriser une infection à Clostridioides difficile (C. difficile), une bactérie pouvant provoquer une diarrhée et une inflammation du côlon. Une dysbiose favorise la multiplication de cette bactérie dont les toxines attaquent la muqueuse intestinale. Les récidives sont un problème majeur puisqu’elles sont relativement fréquentes, entre 15 et 30 %.
Le microbiote vaginal, lui aussi sensible aux antibiotiques
Les antibiotiques peuvent être prescrits pour traiter certaines infections de la sphère génitale, notamment la vaginose bactérienne. Parallèlement, ils peuvent perturber l’équilibre du microbiote vaginal et favoriser la prolifération de Candida, un genre de levures pouvant entraîner une mycose vaginale.
Un microbiote vaginal optimal est naturellement dominé par des bactéries du genre Lactobacillus qui protègent le vagin. Les antibiotiques peuvent ainsi diminuer certaines populations bactériennes protectrices de la flore intime.
Des souches probiotiques sélectionnées et analysées peuvent soutenir le microbiote vaginal lors d’une antibiothérapie.
Les antibiotiques chez les enfants
D’après les données de Santé publique France, les enfants de 0 à 4 ans sont la classe d’âge présentant le taux de prescriptions d’antibiotiques le plus élevé (1326 prescriptions/1000 habitants par an).
Le microbiote intestinal se développe au cours des premières années de vie et continue d’évoluer pendant l’enfance. Durant cette période de maturation, il peut être sensible à différents facteurs, notamment aux antibiotiques.
Des études ont mis en évidence une association entre l’exposition aux antibiotiques pendant l’enfance et un risque ultérieur accru de certaines maladies inflammatoires chroniques de l’intestin ou de maladies à composante allergique, comme l’asthme ou la dermatite atopique.
Soutenir le microbiote pendant une antibiothérapie avec des probiotiques adaptés pour les enfants peut aider à accompagner le microbiote.
La résistance aux antibiotiques : un défi majeur
La résistance aux antibiotiques, ou antibiorésistance, constitue aujourd’hui un enjeu majeur de santé publique à l’échelle mondiale. Elle survient lorsque des bactéries deviennent résistantes à l’action d’un ou de plusieurs antibiotiques. Les infections qu’elles provoquent deviennent alors plus difficiles, voire parfois impossibles à traiter.
L’utilisation excessive ou inappropriée des antibiotiques favorise l’apparition et la propagation de bactéries résistantes.
Et pour les patients en service de chirurgie ?
Une étude réalisée auprès de 54 patients hospitalisés en chirurgie dont certains suivaient une chimiothérapie s’est intéressée aux effets d’un probiotique sur le microbiote intestinal.
Pour cette étude, les participants ont reçu un probiotique multi-espèces en complément de leur traitement. Les résultats sont encourageants car l’incidence de la diarrhée associée aux antibiotiques était de 5,5 % pour ces participants, contre une incidence générale de 25 % mentionnée pour une médication comparable. Le probiotique a par ailleurs été bien toléré par les patients.
Ces résultats prometteurs suggèrent que certaines formulations probiotiques pourraient présenter un intérêt en accompagnement d’un traitement, notamment pour limiter les troubles digestifs associés à la perturbation du microbiote intestinal.
Quels probiotiques pour accompagner un traitement antibiotique ?
Il existe tellement de probiotiques sur le marché qu’il peut être difficile de déterminer lesquels sont réellement efficaces et pertinents. Concentrez-vous sur quelques facteurs essentiels :
- 🔬 Études scientifiques et analyses des souches
- 🦠 Formule multi-espèces
- ☝️ Durée de conservation et stabilité des souches
- ✅ Domaine d’application
- 💊🧪🥛 Forme galénique
- ⭐️⭐️⭐️⭐️⭐️ Avis et évaluations des utilisateurs
- 👩🔬👨⚕️ Conseils d’experts
Si vous avez besoin de conseils, n’hésitez pas à nous contacter à l’adresse suivante 📧france@omni-biotic.com, notre équipe sera ravie de vous aider.
Pourquoi nous conseillons les probiotiques sous forme de poudre ?
Ce que des études ont démontré :
Les souches bactériennes sous forme de poudre sont soigneusement lyophilisées ce qui permet de préserver leur stabilité et leur viabilité pendant le stockage et le transport. Cela permet de minimiser les pertes de bactéries viables.
Par ailleurs, les souches probiotiques sont associées à une matrice spécifique composée d’enzymes et de fibres alimentaires, qui contribue à stabiliser les micro-organismes sous forme de poudre. Lors de l’activation dans l’eau, cette matrice entre en action : elle nourrit et active les bactéries, favorisant ainsi leur activité et leur survie lors du passage dans l’estomac. Elles peuvent ensuite atteindre l’intestin, où elles se multiplient naturellement.
Même lorsqu’une gélule contient des souches bactériennes de haute qualité, leur survie tout au long di transit digestif n'est pas garantie. Selon le type de gélule et sa formulation, les bactéries peuvent être exposées à l’acidité de l’estomac. Une fois libérées dans le duodénum*, elles rencontrent également les sels biliaires, qui peuvent affecter leur viabilité. Ainsi, le nombre de micro-organismes encore vivants peut diminuer au cours du transit digestif, et seule une fraction des bactéries initialement ingérées peut atteindre le gros intestin sous forme viable.
Il ne suffit pas d’ouvrir une gélule et de verser son contenu dans l’eau. La formulation joue un rôle essentiel : une matrice spécifiquement conçue pour protéger et accompagner les bactéries peut favoriser leur viabilité pendant leur transit digestif.
Généralement, les yaourts contiennent naturellement des bactéries d'origine animale et des cultures de yaourt indispensables à leur fabrication. Elles ne colonisent pas l'organisme humain et sont généralement rapidement éliminées par les selles. Selon des études, on observe par exemple, dans le cas de L. bulgaricus, une diminution significative du nombre de bactéries vivantes dès l’estomac, suivie d’autres pertes dans le gros intestin.
Un yaourt ordinaire n’est donc pas comparable à une préparation probiotique spécifiquement formulée. L’efficacité de celle-ci repose notamment sur le choix des souches bactériennes, leur quantité et leur capacité à rester stables et viables jusqu’à leur site d’action.
*Le duodénum est la première partie de l’intestin grêle. Il joue un rôle important dans la digestion en recevant la bile provenant du foie et les enzymes digestives sécrétées par le pancréas.
